乙訓ひまわり園ワークセンターは、平成12年11月1日、比較的障害の軽い人たちの働く場を目的とした30人定員の知的障害者授産施設として、ひまわり園本棟の建物の2階部分でオープンした。開所当時の利用者は19名で、ひまわり園利用前の状況は、他施設に7名、在宅及び小規模作業所に12名の方がおられた。その後平成13年3月に2名、4月に9名、9月に1名の利用者を迎え、2名の退所があり、31名の在籍となった。

平成16年度4月に養護学校卒業生1名を迎え、現在32名の在籍者となっている。